Tak jsem asi našel odpověď v oficiálních erratech.

Obecně lze karty odhazovat ve chvíli, kdy jsou již všechny “sloty” obsazeny. Jen v tomto případě je možné karty odhazovat. A tedy i v případě, že u vesničana již leží karta vyšetřování.

Tedy správně je, zdá se, příklad A, tedy kartu odhodím a zahraji novou.

Info přímo od autora hry: 

Všechny karty, co se v průběhu hry umisťují do slotů na herní ploše (čili vše kromě kouzel a událostí) mohou být odstraněny, jakmile jsou všechny sloty v dané sekci zaplněny. 

Karty vyšetřování mají drobnou výjimku, a to, že každý vesničan se považuje za samostatnou sekci. Nemusí tak být zaplněno všech 9 karet vesničanů, ale stačí karty nahrazovat přímo u konkrétního vesničana. Zároveň, pokud hra neřekne jinak, samozřejmě platí, že u každého vesničana může být jen 1 karta, pokud je tak vyšetřování např. na straně čarodějnice, celý obyvatel se tak považuje za obsazeného a pokud bys na něj chtěl vyložit kartu vyšetřování ze strany lovce, musíš tu na protější straně odstranit.

A ještě další malá výjimka, ale celkem logická a intuitivní, je pro karty prokletí. Tam můžeš po zaplnění všech 3 slotů kteroukoliv odstranit a nahradit, vždy však napřed zbývající dvě sesuneš doleva, abys platil za vyložení do nejdražšího slotu (+2).

Snad to dává smysl :)   

@Navy